Руководителем блока является заместитель директора по охране и реставрации объектов культурного и природного наследия, капитальному ремонту и реконструкции музейных объектов — Александр Владимирович Алексеев.

В состав блока входят следующие структурные подразделения:

• Отдел учета и хранения объектов культурного и природного наследия, заведующий отделом — Лариса Александровна Петровская;
• Отдел организации проектных и реставрационных работ по памятникам, заведующий отделом — Татьяна Валентиновна Шилова.

Основные задачи деятельности данного блока:

1. Учет и хранение объектов культурного и природного наследия (недвижимых памятников истории и культуры, комплексов и историко-культурных территорий, достопримечательных природных объектов, культурных и ценных природных ландшафтов);
2. Мониторинг состояния объектов культурного и природного наследия, оперативный контроль их использования;
3. Правовое, проектное, программное и научно-методическое обеспечение содержания и использования объектов культурного и природного наследия, флоры и фауны архипелага и его морской акватории. Участие в разработке и реализации программ и планов научно-исследовательской, образовательной и просветительской деятельности музея;
4. Разработка рекомендаций, плановых мероприятий по сезонной консервации недвижимых памятников и контроль за исполнением утвержденных мероприятий;
5. Обеспечение организации проектно-исследовательской, консервационной, реставрационной, ремонтной и строительной деятельности на объектах и территории Соловецкого музея-заповедника;
6. Учет и контроль за исполнением договоров подряда, касающихся проектно-исследовательской, консервационной, ремонтно-реставрационной деятельности на объектах культурного и природного наследия, находящихся в управлении СГИАПМЗ;
7. Осуществление профессиональной помощи другим подразделениям музея при производстве ремонтно-строительных работ на объектах и территории музея.

Результаты работы блока:

Отделом учета и хранения объектов культурного и природного наследия:

1. Проводится научная и техническая паспортизация, и регистрация права оперативного управления;
2. Ведется электронная база данных по объектам культурного наследия «КАИСА»;
3. В целях сохранения природной среды Соловков в 2003 году начата программа мониторинга природной среды Соловецкого архипелага;
4. Ведется работа по получению земельных участков под объектами музея и подготовке пакетов документов на данные участки:

   • 29 участков под объектами музея-заповедника на территории муниципального образования получены в постоянное пользование, 2 участка в аренде;
   • ведется работа по получению участка под строительство сарая для пиломатериалов на территории муниципального образования и участка исторически занятого лодочной станцией на территории гослесфонда.

5. В штате блока работает археолог — А.Я.  Мартынов, к.ист.н., возглавляющий Соловецкую археологическую экспедицию по первобытной археологии:

   • За период с 1982 по 2008 гг. экспедицией открыты в Поморье более 250 памятников и объектов первобытной и средневековой археологии (стоянки, мастерские, местонахождения, мегалитические выкладки), в том числе 230 — на островах Белого моря, 125 — на Соловецком архипелаге.
   • В той или иной степени раскопаны 40 памятников и объектов первобытной археологии;
   • В фонды СГИАПМЗ сданы около 30000 артефактов;
   • Опубликованы более 40 научных статей и тезисов докладов, прочитанных на региональных, союзных и международных конференциях, монография «Археологические памятники Соловецкого архипелага» (Архангельск, 2002) и научно-популярная книга «Древними тропами Соловецких островов» (Москва, 2006);
   • В 2006 году проведена впервые на Соловках международная археологическая конференция на тему «Первобытная и средневековая история и культура Европейского Севера: проблемы изучения и научной реконструкции» и выпущен одноименный сборник докладов и статей.

6. Средневековым отрядом Соловецкой археологической экспедиции под руководством В.А. Бурова, к.ист.н., в период с 2001 по 2007 гг. велись раскопки на памятниках ансамбля монастыря — Соловецкой крепости 16 в., Мельнице 17 в, Благовещенском корпусе 17–19 вв., Святительском корпусе 17–19 вв., Филипповской церкви 18 в., церкви Преподобного Германа 17–19 вв., келейном корпусе 17 в., а так же археологические исследования на территории Сарая завода глиняной посуды в пос. Соловецкий. Археологические раскопки при ремонте Новобратского корпуса выявили остатки древних построек 17 в, дали материал, позволивший музею основать экспозицию «Подземные Соловки». Раскоп в районе аэропорта пополнил коллекцию монастырских кованых орудий труда. В раскопках принимали активное участие волонтерские группы — «Рождественка» (г. Москва) и Архангельский городской штаб школьников. В фонды музея сданы 4614 находок. Научные отчеты об археологических раскопках хранятся в архиве музея.

Отдел организации проектных и реставрационных работ:

1. Ежегодно проводит исследовательские и проектные работы, формирует задел проектно-сметной документации, обеспечивающий перспективу увеличения финансирования на реставрацию, капитальный ремонт и реконструкцию памятников;
2. Технический архив сектора насчитывает 2604 единиц хранения по 79 разделам;
3. В 2008 году были запланированы и выполнены:

   • реставрационные работы на 4 ярусе Колокольни, работы по приспособлению барака УСЛОН для размещения экспозиции, Прачечном корпусе (ремонт и приспособление под депозитарий музея);
   • проектные работы: по Такелажному амбару, Амбару для хранения сала, Преображенской гостинице, археологической части Келейного корпуса XVII века., Сушилу 16 в., Монастырской гидроэлектростанции н. 20 в.

4. В рамках Федеральной адресной инвестиционной программы ведутся производственные и проектные работы по реконструкции объектов музея:
   • инженерные сети;
   • водоотведение с территории Соловецкого кремля;
   • монастырский причал в гавани Благополучия;
   • монастырская гидроэлектростанция;
   • станция перекачки сточных вод и напорный канализационный коллектор;
   • материально-технический комплекс Соловецкого музея-заповедника.

5. Мониторинг объектов культурного наследия:

   • Начиная с 2005 года, в рамках наблюдения за техническим состоянием памятников специализированной организацией были выполнены исследования инженерной устойчивости 26 объектов, получены данные, являющиеся основой для дальнейших наблюдений. Ведется текущий контроль за состоянием ряда объектов.